Das Klima und der CO₂-Gehalt der Atmosphäre ändern sich rasch, und die damit verbundenen Wetterextreme wirken sich auf die Wälder des Amazonas aus.

Die Entwaldung und die erhöhte Baumsterblichkeit beeinflussen das regionale Klima ebenfalls. Ein wichtiges Ziel von ATTO ist es, zu beobachten, wie Veränderungen der Wechselwirkungen zwischen Wald und Atmosphäre in Verbindung mit extremen Wetterereignissen die regionale und globale Rolle des Amazonas beeinflussen. Ein Beispiel ist die Rolle von Windwürfen – Bäume, die durch Fallwinde im Zusammenhang mit starken konvektiven Stürmen umknicken oder entwurzelt werden. Forschende untersuchen die Auswirkungen dieser Ereignisse auf die Artenvielfalt, die Struktur und die Kohlenstoffbilanz tropischer Wälder. Es zeigt sich, dass sich die Wälder zwar schnell von Windwürfen erholen können, die Artenvielfalt und die Menge des gespeicherten Kohlenstoffs aber oft über lange Zeiträume deutlich geringer bleibt.